Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF680Q8NEM1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF680Q8NEM1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF680Q8NEM1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF680Q8NEM1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF680Q8NEM1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF680Q8NEM1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF680Q8NEM1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF680Q8NEM1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF680Q8NEM1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZNF680Q8NEM1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF680Q8NEM1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms