Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIK3C3Q8NEB9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms