Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
BHLHE23Q8NDY6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE23Q8NDY6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms