Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00301Q8NCQ3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms