Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACBD4Q8NC06 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms