Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms