Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71E2Q8N5Q1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM71E2Q8N5Q1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms