Protein–RNA interactions for Protein: Q86US8

SMG6, Telomerase-binding protein EST1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6Q86US8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMG6Q86US8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG6Q86US8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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