Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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