Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CATSPER4Q7RTX7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms