Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BHLHA9Q7RTU4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHA9Q7RTU4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms