Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTF1AQ7RTS3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms