Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHST3Q7LGC8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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