Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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USP43Q70EL4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP43Q70EL4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP43Q70EL4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP43Q70EL4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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USP43Q70EL4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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