Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
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