Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAXIP1Q6ZW49 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms