Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRIG3Q6UXM1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms