Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms