Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms