Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q6Q795 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q6Q795 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6Q795 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6Q795 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6Q795 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6Q795 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q6Q795 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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