Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOA5Q6Q788 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms