Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF544Q6NX49 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms