Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms