Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFCAB2Q5VUJ9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFCAB2Q5VUJ9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFCAB2Q5VUJ9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms