Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NHSL1Q5SYE7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms