Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms