Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LDLRAP1Q5SW96 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms