Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP170Q5SW79 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms