Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
WDR44Q5JSH3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
WDR44Q5JSH3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms