Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALFQ53S48 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALFQ53S48 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms