Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL12Q53G59 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL12Q53G59 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms