Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC153Q494R4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms