Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms