Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q1T7F1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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