Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms