Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTN1Q16799 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RTN1Q16799 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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