Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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RPE65Q16518 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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RPE65Q16518 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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