Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRK1Q15835 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRK1Q15835 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms