Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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