Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NKX1-1Q15270 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKX1-1Q15270 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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