Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
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PTPRKQ15262 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
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PTPRKQ15262 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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PTPRKQ15262 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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PTPRKQ15262 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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PTPRKQ15262 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
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PTPRKQ15262 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
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PTPRKQ15262 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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PTPRKQ15262 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRKQ15262 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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