Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDGFRLQ15198 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDGFRLQ15198 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms