Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPD2Q15021 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms