Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFIXQ14938 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFIXQ14938 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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