Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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