Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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