Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA9Q13797 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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