Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
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SHROOM2Q13796 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
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SHROOM2Q13796 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
SHROOM2Q13796 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHROOM2Q13796 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
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