Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
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