Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDH18Q13634 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH18Q13634 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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